【南林新聞中心訊】近日，國際園藝學(xué)會石榴工作組主席、我校苑兆和教授領(lǐng)銜的研究團隊，經(jīng)過不懈努力成功破譯石榴全基因組，并組裝出高質(zhì)量基因組草圖。相關(guān)研究成果于6月14日作為封面文章正式刊發(fā)于國際植物學(xué)科權(quán)威期刊Plant Biotechnology Journal（IF=7.443），標志著我校科研團隊在該領(lǐng)域研究中達到國際領(lǐng)先水平。我校苑兆和教授、方炎明教授、張?zhí)┦浚绹的螤柎髮W(xué)費章君教授，北京百邁克公司韓鳳鳴博士為本文共同第一作者，苑兆和教授和方炎明教授為共同通訊作者。

該研究首次從組學(xué)角度確立了石榴分類學(xué)地位，系統(tǒng)闡釋了石榴基因組重復(fù)序列的進化和功能，結(jié)合轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析闡明了石榴果實品質(zhì)形成機理和胚珠發(fā)育生物學(xué)等科學(xué)問題，為石榴遺傳與育種研究提供參考基因組資源。

期刊封面

石榴基因組約為336Mb，組裝大小為274 Mb，重復(fù)序列比例高達51.2%，共預(yù)測出30903條基因。之前學(xué)界一直認為石榴屬屬于石榴科，苑兆和教授領(lǐng)銜的研究團隊首次通過比較基因組分析，從分子層面確立了石榴分類學(xué)地位，支持石榴屬劃歸為千屈菜科。通過古基因組學(xué)研究，發(fā)現(xiàn)石榴與近緣物種巨桉共有一次古四倍化事件和雙子葉植物共有的古六倍化事件，為進化基因組研究提供了參考基因組資源。石榴重復(fù)序列中大型逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子衍生物家族近期發(fā)生大規(guī)模種系特異性復(fù)制，并與果實發(fā)育過程中的著色和胚珠發(fā)育等功能性狀相關(guān)。高質(zhì)量石榴參考基因組的破譯將促進石榴遺傳改良研究，為廣泛的植物比較與進化基因組研究以及對獨特果實品質(zhì)形成機理研究提供基因組資源。

石榴是一古老樹種，集生態(tài)、經(jīng)濟和社會效益，以及觀賞價值與保健等功能于一體，其果實富含安石榴苷等鞣花丹寧類抗氧化活性物質(zhì)，被譽為超級水果、保健水果。近年來，石榴作為新興果樹在中國、印度、伊朗、美國、西班牙、以色列、土耳其、意大利、俄羅斯、南非、智利等國家廣泛栽培，發(fā)展勢頭迅猛，也是國家規(guī)劃特色經(jīng)濟林樹種之一。此次苑兆和教授團隊的研究成果對石榴果實品質(zhì)改良和國際石榴產(chǎn)業(yè)發(fā)展將產(chǎn)生深遠影響。

石榴基因組重復(fù)序列LARD家族進化與表達

該研究得到了國家自然科學(xué)基金、江蘇省高校優(yōu)勢學(xué)科建設(shè)工程項目、南京林業(yè)大學(xué)高層次人才科研啟動基金項目、江蘇省普通高校研究生科研創(chuàng)新計劃項目、南京林業(yè)大學(xué)優(yōu)秀博士學(xué)位論文創(chuàng)新基金項目以及美國國家科學(xué)基金項目的資助。

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網(wǎng)址: 我校石榴研究團隊在國際植物學(xué)權(quán)威期刊發(fā)表封面文章 http://m.u1s5d6.cn/newsview793410.html