HepaAiQ?:基于血液ctDNA甲基化信號的肝癌早診方法
2022年美國臨床腫瘤學會(ASCO)年會將于2022年6月3日~7日在美國伊利諾伊州芝加哥以線上+線下的會議形式舉行。
會議上,復旦大學附屬中山醫(yī)院樊嘉院士、周儉教授等領銜的研究團隊與鹍遠生物共同報道了一種基于血液ctDNA甲基化信號的肝癌早診方法-HepaAiQ?(大會摘要號:Abstract:4103)[1]。
研究結果顯示:HepaAiQ?檢測性能優(yōu)異,在健康人群中的特異性為93.4%、肝癌診斷的靈敏度高達87.2%,尤其對于早期肝癌也顯示出優(yōu)異診斷性能(靈敏度為83.2%)。
此外,由于HepaAiQ?基于更敏感和經濟的qPCR檢測平臺,覆蓋人群廣泛,有望為眾多肝癌高危人群帶來更為精準的診斷。
肝細胞癌(Hepatocellular carcinoma, HCC)是肝癌的主要組織學亞型,占原發(fā)性肝癌的90%,是全世界常見的惡性腫瘤之一,也是慢性肝病患者最常見的死亡原因。
我國是肝癌高發(fā)大國,在惡性腫瘤中肝癌的發(fā)病率位居前四,死亡率位居第二,僅次于肺癌[2]。根據國家癌癥中心發(fā)布的最新一期全國癌癥統計數據顯示:2016年我國肝癌新發(fā)病例和死亡病例分別約為38.9萬例和33.6萬例[2]。
由于HCC起病隱匿,早期很少出現特殊或明顯的癥狀,70%-80%HCC患者一旦確診即為中晚期,病程短,預后差,5年生存率僅約為14.1%[ 3]。如果能夠盡早發(fā)現,患者將可以得到更有效的手術治療,據統計早期HCC的5年生存率可高達90%[3,4]。因此,對高風險人群實施早期篩查,可實現早期診斷和早期治療,從而達到長期生存。 目前,HCC仍缺乏有效的早期篩查手段,傳統手段的檢測性能和可及性制約了臨床篩查的有效實施。 目前HCC篩查方式主要包括血液學AFP(甲胎蛋白)檢測和影像學檢查。 從目前診療路徑來看[3,5],HCC早篩通常聯合AFP和肝臟超聲(US)對HCC高危人群進行定期篩查,發(fā)現異常再進一步考慮CT或者核磁共振檢查。
甲胎蛋白(AFP)是目前診斷HCC應用最多的血清學標志物,但仍有近40%HCC患者AFP持續(xù)在正常或較低水平,而且妊娠、活動性肝炎、生殖系統腫瘤、胃腸胰腺等其他消化道腫瘤等人群血清AFP也會升高[6]。
超聲(US)設備簡單,價格低容易開展,在臨床上廣泛應用,但其對早期HCC診斷靈敏度僅47%[7],且受肝硬化結節(jié)干擾,對操作者經驗要求較高。
即使應用AFP和超聲聯合檢測,對早期HCC的靈敏度也僅有63%[7],仍然無法滿足早期HCC篩查的需求。
CT平掃對于極早期HCC(<1 cm)或密度近似正常肝實質的HCC難以顯示,且具有一定的放射性[8-10]。
MRI雖然性能較超聲(US)和CT較大提升,但檢測的靈敏度和特異性也存在一定的天花板[10],且我國人口基數大、經濟水平不足,將其作為常規(guī)篩查手段也不大現實。
因此,我國迫切需要開發(fā)一種適用于廣泛人群的有效、經濟、實用的HCC早期手段?;诖?, 本研究開發(fā)和驗證了一種無創(chuàng)經濟的血液ctDNA甲基化檢測方法,實現高危人群的早期預警。
一、研究方法
圖1. 研究設計
研究人員通過MONOD?技術對組織樣本進行全基因組簡化甲基化測序(Reduced Representation Bisulfite Sequencing,RRBS),初步遴選出HCC特異性相關的甲基化標志物。通過mTitan?靶向甲基化測序技術對血漿樣本驗證,靶點同步進行文獻檢索和功能富集,進一步優(yōu)化HCC特異性相關的高性能標志物。
研究甄選出最優(yōu)的甲基化標志物若干,再通過大量臨床血漿樣本構建HCC多基因甲基化血液檢測模型-HepeAiQ?,并對HepeAiQ?模型進行盲法驗證,測試模型的普適性和穩(wěn)定程度。
二、研究結果
1. HCC特異性甲基化標志物發(fā)現和優(yōu)化
本研究利用MONOD?對37個HCC組織、26個正常組織、20個白細胞和114個空白對照(血漿)進行RRBS,遴選出數百個HCC特異性相關的甲基化標志物(圖2),并以5個有代表性的標志物為例評估其對HCC的檢測性能,發(fā)現其在HCC甲基化程度顯著高于其他樣本(圖3)。 圖2. HCC特異性甲基化標志物熱圖
圖3. 甲基化標志物鑒別HCC的性能評估
2. NGS血檢模型性能優(yōu)異,AUC可達0.98以上
研究者對276個HCC和393個空白對照(血漿)進行mTitan?靶向甲基化測序,結果顯示該模型性能相當優(yōu)異,其平均AUC為0.985(圖4)。
圖4. HCC特異性甲基化標志物NGS panel性能表現
3. 多重PCR檢測HepaAiQ?模型建立及驗證 考慮到簡化多重qPCR檢測方法在臨床上的適用性,研究者進一步使用559個血漿樣本,包括293個HCC樣本、60個肝硬化樣本(LC)、36個慢性乙型肝炎樣本(CHB)和170個健康對照樣本(CTRL),對HCC靶點做進一步甄選優(yōu)化,建立多重PCR檢測方法(HepaAiQ?)。 結果發(fā)現,HepaAiQ?檢測在LC、CHB和CTRL的特異性分別為88.3%、91.7%和92.4%的情況下,HCC靈敏度可達85.3%。緊接著,HepaAiQ?模型對來自多中心的374份血漿樣本進一步盲法驗證,證實其對HCC的敏感性為87.2%,對LC、CHB和CTRL的特異性分別為86.8%、90.5%和93.4%(表2)。
表2. 驗證試驗中HepaAiQ?的性能表現
4. 相比AFP篩查方法,HepaAiQ?具有顯著優(yōu)越性
研究者將HepaAiQ?與HCC傳統篩查方法AFP方法進行了比較。結果顯示,HepaAiQ?在各個分期中的表現均優(yōu)于AFP(87.0% vs. 56.2%),尤其是在早期HCC中(83.2% vs. 48.5%)(圖5)。
圖5. HepaAiQ?與AFP在HCC診斷中的表現
該研究開發(fā)了一種基于血液ctDNA甲基化信號的HCC早檢方法---HepaAiQ?。HepaAiQ?檢測性能優(yōu)異,尤其對于早期HCC具有良好的靈敏度和特異性,可實現早期HCC的精準檢測。
參考文獻:
[1] Xinrong Yang, Yingchao Wang, De-Zhen Guo,et al. Discovery and clinical validation of cost-effective non-invasive early detection of hepatocellular carcinoma (HCC) through circulating tumor DNA (ctDNA) methylation signature 2022 ASCO Annual meeting. Abstract #4103.
[2] Zheng R , Zhang S , Zeng H , et al. Cancer incidence and mortality in China, 2016[J]. Journal of the National Cancer Center, 2022.2(1):1-9.
[3]全國多中心前瞻性HCC極早期預警篩查項目(PreCar)專家組. 中國HCC早篩策略專家共識[J]. 肝臟, 2021, 26(8):7.
[4] ESMO Guidelines Working Group. Hepatocellular carcinoma: ESMO-ESDO Clinical Practice Guidelines for diagnosis, treatment and follow-up[J]. Ann Oncol, 2012;23 Suppl 7:vii41-8.
[5] 中華人民共和國國家衛(wèi)生健康委員會. 原發(fā)性HCC診療指南(2022年版)[J]. 中華普通外科學文獻:電子版, 2022, 16(2):16.
[6] AlSalloom AA. An update of biochemical markers of hepatocellular carcinoma. Int J Health Sci (Qassim). 2016 Jan;10(1):121-36.
[7] Tzartzeva K, Obi J, Rich NE, et al. Surveillance Imaging and Alpha Fetoprotein for Early Detection of Hepatocellular Carcinoma in Patients With Cirrhosis: A Meta-analysis. Gastroenterology. 2018 May;154(6):1706-1718.e1.
[8] 中華醫(yī)學會肝病學分會. 原發(fā)性HCC二級預防共識(2021年版)[J]. 中華肝臟病雜志, 2021, 29(3):11.
[9] 夏鋒, 張大志. 肝細胞癌癌前病變的診斷和治療多學科專家共識(2020版)[J]. 中華肝臟病雜志, 2020, 28(1):7.
[10] Jiang HY, Chen J, Xia CC, Cao LK, Duan T, Song B. Noninvasive imaging of hepatocellular carcinoma: From diagnosis to prognosis. World J Gastroenterol. 2018 Jun 14;24(22):2348-2362.
文章來源:《國際肝病》編輯部
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