中新網(wǎng)深圳8月8日電 (記者 索有為)華大集團(tuán)8日發(fā)布消息稱，瑞典烏普薩拉大學(xué)近日聯(lián)合華大集團(tuán)旗下的華大生命科學(xué)研究院、華大基因(46.090, 0.44, 0.96%)智惠醫(yī)學(xué)研究院，對(duì)逾千例結(jié)直腸癌樣本進(jìn)行了全基因組及轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析，發(fā)現(xiàn)了一系列與癌癥不同階段相關(guān)的基因，并識(shí)別了結(jié)直腸癌關(guān)鍵預(yù)后因子，為結(jié)直腸癌的預(yù)防、治療及預(yù)后提供了數(shù)據(jù)基礎(chǔ)，相關(guān)研究成果于8月7日發(fā)表于全球頂級(jí)學(xué)術(shù)期刊《自然》(Nature)，這也是目前全球最大的結(jié)直腸癌多組學(xué)研究。

據(jù)介紹，全球每年新增結(jié)直腸癌病例約190萬(wàn)，結(jié)直腸癌發(fā)病率居所有癌癥第三位，約20%的患者在確診時(shí)已發(fā)生轉(zhuǎn)移，結(jié)直腸癌死亡率高居各類癌癥第二位。

該研究基于華大智造(54.200, 1.28, 2.42%)DNBSEQ測(cè)序平臺(tái)，對(duì)瑞典知名癌癥樣本與數(shù)據(jù)庫(kù)U-CAN隊(duì)列中的1063例結(jié)直腸癌樣本進(jìn)行全基因組和轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析，鑒定得到了96個(gè)顯著突變基因，其中，有24個(gè)為新發(fā)現(xiàn)的潛在驅(qū)動(dòng)基因，而與WNT, EGFR和TGF-β通路相關(guān)的驅(qū)動(dòng)基因與結(jié)直腸癌生存顯著相關(guān)。不僅如此，研究人員還利用突變時(shí)序分析，推導(dǎo)出了9個(gè)與癌癥發(fā)生早期事件相關(guān)的驅(qū)動(dòng)突變基因，和更傾向于在癌癥發(fā)生的后期階段出現(xiàn)的突變基因。這些發(fā)現(xiàn)為結(jié)直腸癌的早期檢測(cè)和靶向治療的開(kāi)發(fā)提供了臨床研究策略，并揭示了與腫瘤后期侵襲和轉(zhuǎn)移相關(guān)的重要分子變化。

該研究中，研究人員通過(guò)全基因組和轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析發(fā)現(xiàn)在線粒體基因組和非編碼區(qū)域中也存在與疾病相關(guān)的突變，并對(duì)與疾病進(jìn)展顯著相關(guān)的突變進(jìn)行了系統(tǒng)性的總結(jié)，這些突破性的發(fā)現(xiàn)填補(bǔ)了非編碼區(qū)在結(jié)直腸癌相關(guān)研究中的空白，將進(jìn)一步推動(dòng)對(duì)結(jié)直腸癌發(fā)病機(jī)制的理解。

隨后，分析團(tuán)隊(duì)利用同一腫瘤樣本的基因組和轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進(jìn)行了整合分析，驗(yàn)證了無(wú)論是否為微衛(wèi)星不穩(wěn)定腫瘤，其抑癌基因上的突變均導(dǎo)致基因表達(dá)降低，從而更容易患癌。進(jìn)一步地，研究團(tuán)隊(duì)基于腫瘤基因表達(dá)差異，將結(jié)直腸癌預(yù)后分為了5個(gè)預(yù)后亞型CRPS，相較于結(jié)直腸癌經(jīng)典的共識(shí)分子分型CMS，該研究構(gòu)建的CRPS能更加準(zhǔn)確地預(yù)測(cè)預(yù)后。

文章通訊作者、烏普薩拉大學(xué)的Tobias Sj?blom教授表示，該研究實(shí)現(xiàn)了迄今為止最大規(guī)模的結(jié)直腸癌基因組和轉(zhuǎn)錄組的綜合分析，并將分子層面的發(fā)現(xiàn)與高質(zhì)量的臨床數(shù)據(jù)相結(jié)合，從而識(shí)別關(guān)鍵預(yù)后因子，這使這項(xiàng)研究有別于其他絕大多數(shù)癌癥基因組學(xué)的研究。

文章共同通訊作者、華大基因智惠醫(yī)學(xué)研究院林從博士表示，此次通過(guò)將華大先進(jìn)的基因組學(xué)技術(shù)和數(shù)據(jù)分析資源應(yīng)用于大規(guī)模結(jié)直腸癌人群，不僅發(fā)現(xiàn)多種突變事件對(duì)預(yù)后的顯著預(yù)測(cè)效應(yīng)，新構(gòu)建的表達(dá)譜精細(xì)分型也將在未來(lái)指導(dǎo)結(jié)直腸癌個(gè)體化診療中發(fā)揮重要作用。期望未來(lái)能更加系統(tǒng)深入地解析不同腫瘤的發(fā)生發(fā)展機(jī)制，真正實(shí)現(xiàn)腫瘤的早診早治。(完)

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