首頁(yè) 資訊 Nature系列綜述:沈漢明/王立明等系統(tǒng)介紹微自噬的分子調(diào)控機(jī)制和病生理功能

Nature系列綜述:沈漢明/王立明等系統(tǒng)介紹微自噬的分子調(diào)控機(jī)制和病生理功能

來(lái)源:泰然健康網(wǎng) 時(shí)間:2024年12月02日 15:45

細(xì)胞內(nèi)物質(zhì)代謝平衡及各種細(xì)胞器功能正常行使是生命活動(dòng)的基礎(chǔ)。 自噬 (autophagy) 是機(jī)體細(xì)胞通過(guò)溶酶體 (lysosome) 降解內(nèi)容物 (包括蛋白質(zhì)等生物大分子或受損細(xì)胞器等) 實(shí)現(xiàn)物質(zhì)再循環(huán)利用,從而維持細(xì)胞內(nèi)穩(wěn)態(tài)的一種高度進(jìn)化保守的過(guò)程。

在哺乳動(dòng)物細(xì)胞中,根據(jù)內(nèi)容物的性質(zhì)及其被運(yùn)送到溶酶體的方式,自噬可主要分為巨自噬 (macroautophagy;一般和自噬autophagy通用) 、微自噬 (microautophagy) 和分子伴侶介導(dǎo)的自噬 (chaperone-mediated autophagy,CMA) 1。其中,巨自噬及CMA的分子機(jī)制和生物醫(yī)學(xué)功能已被深入廣泛研究,但微自噬的研究卻相對(duì)缺乏。近年來(lái),隨著技術(shù)手段的進(jìn)步,對(duì)微自噬的研究正逐漸深入,其重要的生物學(xué)功能也越來(lái)越受到關(guān)注。 

2022年9月13日,湖南大學(xué)生命醫(yī)學(xué)交叉研究院王立明教授、美國(guó)密歇根大學(xué)Daniel J. Klionsky教授和澳門大學(xué)的沈漢明教授聯(lián)合在 Nature Reviews Molecular Cell Biology 期刊上發(fā)表題為: The emerging mechanisms and functions of microautophagy 的綜述文章,首先全面深入地概括了近年來(lái)有關(guān)微自噬的研究進(jìn)展,重點(diǎn)介紹了多種形式的選擇性微自噬 (selective microautophagy) ,并詳細(xì)討論了微自噬的分子調(diào)控機(jī)制,微自噬與巨自噬的區(qū)別與聯(lián)系,以及微自噬與人類重大疾病 (例如癌癥和神經(jīng)退行性疾?。?發(fā)生和進(jìn)展的關(guān)系。 81791663283515061

一、巨自噬,CMA和微自噬 

1963年比利時(shí)科學(xué)家 Christian de Duve 首次在溶酶體國(guó)際會(huì)議上提出了‘自噬’的概念,1974年 Duve 因發(fā)現(xiàn)溶酶體獲得了諾貝爾生理或醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)。然而,此后的數(shù)十年內(nèi),關(guān)于自噬的研究一直進(jìn)展緩慢。直到上世紀(jì)90年代,大隅良典等科學(xué)家在酵母中篩選出多個(gè)自噬相關(guān)基因 (autophagy-related genes,Atgs) 并闡明了其核心調(diào)控機(jī)制,自噬研究才開(kāi)始迎來(lái)大“爆發(fā)”時(shí)期,大隅良典也因這一開(kāi)創(chuàng)性的貢獻(xiàn),榮獲2016年諾貝爾生理或醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)。 

到目前為止,自噬的研究大多集中在巨自噬和CMA上。巨自噬的典型特征是形成一種獨(dú)特的雙膜細(xì)胞器,即自噬小體 (autophagosome) ,通過(guò)和晚期內(nèi)吞體 (late endosome) 及溶酶體融合,形成自噬溶酶體(autolysosome)從而降解內(nèi)含物 (見(jiàn)圖1a) 。CMA則能夠?qū)⒓?xì)胞質(zhì)中帶有KFERQ樣序列的蛋白質(zhì)靶向運(yùn)送到溶酶體,進(jìn)行選擇性降解 (見(jiàn)圖1b) 。而微自噬指的是通過(guò)溶酶體或晚期內(nèi)吞體 [二者融合形成內(nèi)吞溶酶體(endolysosome)] 直接吞噬降解內(nèi)含物的過(guò)程,其主要有三種方式:溶酶體膜突起、溶酶體膜內(nèi)陷和晚期內(nèi)吞體膜內(nèi)陷 (見(jiàn)圖1c) 。 13431663283515179

圖1. 哺乳動(dòng)物的巨自噬、CMA和微自噬過(guò)程 

二、非選擇性和選擇性微自噬 

根據(jù)被降解底物是否有特異性,巨自噬可以是選擇性和非選擇性的。同樣,微自噬也可以分為非選擇性微自噬 (non-selective microautophagy) 和選擇性微自噬 (selective microautophagy) 。到目前為止,哺乳動(dòng)物非選擇性微自噬的研究仍然非常薄弱,分子機(jī)制和生理病理功能遠(yuǎn)未明確。

然而,近年來(lái),人們對(duì)于選擇性微自噬的研究取得了一定的進(jìn)展,已經(jīng)報(bào)道了一系列選擇性微自噬類型 (圖2) ,包括微線粒體自噬 (micromitophagy) 、微內(nèi)質(zhì)網(wǎng)自噬 (microreticulophagy) 、微細(xì)胞核自噬 (micronucleophagy) 、微溶酶體自噬 (microlysophagy )、微脂噬 (microlipophagy) 、內(nèi)吞體微自噬 (endosomal microautophagy,eMI) 以及微蛋白質(zhì)自噬 (microproteophagy) 。 76701663283515354

圖2. 哺乳動(dòng)物的選擇性微自噬通路 

三、微線粒體自噬 

作為細(xì)胞的“發(fā)電廠”,線粒體為細(xì)胞幾乎所有的生命活動(dòng)提供能量,因此,線粒體質(zhì)量控制對(duì)維持線粒體穩(wěn)態(tài)和正常生理功能至關(guān)重要。受損傷的線粒體可以通過(guò)多種途徑被降解,包括線粒體蛋白酶、泛素-蛋白酶體系統(tǒng)、巨線粒體自噬(或線粒體自噬)以及微線粒體自噬。其中,微線粒體自噬指的是不依賴于自噬體而直接通過(guò)溶酶體降解線粒體的過(guò)程,包括兩種線粒體衍生囊泡 (Mitochondrial-derived vesicles,MDVs) 介導(dǎo)的途徑5,6和SPATA18/Mieap誘導(dǎo)線粒體內(nèi)溶酶體樣細(xì)胞器累積 (SPATA18/Mieap-induced accumulation of lysosome-like organelles within mitochondria,MALM) 以及SPATA18/Mieap誘導(dǎo)液泡樣結(jié)構(gòu) (SPATA18/Mieap-induced vacuole,MIV) 介導(dǎo)的途徑,具體發(fā)生機(jī)制如圖3所示。 

四、CMA和微自噬降解胞質(zhì)單個(gè)蛋白質(zhì) 

蛋白質(zhì)穩(wěn)態(tài) (proteostasis) 失衡是衰老和疾病的九大特征之一,其可以被泛素-蛋白酶體系統(tǒng)和自噬 (包括巨自噬、CMA以及微自噬) 調(diào)控。其中,巨自噬主要降解細(xì)胞內(nèi)大的不溶性蛋白聚集體,而CMA和eMI以及microproteophagy (作者首次命名) 等微自噬可以降解細(xì)胞內(nèi)單個(gè)蛋白質(zhì) (見(jiàn)圖4) 。CMA是一種降解單個(gè)蛋白質(zhì)的選擇性自噬,其通過(guò)分子伴侶HSPA8特異性識(shí)別帶KFERQ樣序列蛋白質(zhì)形成復(fù)合體,與溶酶體膜蛋白LAMP2A結(jié)合,完成蛋白質(zhì)的去折疊和溶酶體轉(zhuǎn)運(yùn)、降解。

與CMA類似,eMI也可以特異性識(shí)別帶KFERQ樣序列的蛋白質(zhì),通過(guò)和晚期內(nèi)吞體或MVBs (multivesicular bodies)膜上的絲氨酸磷脂 (phosphatidylserine) 結(jié)合,在ESCRTs幫助下進(jìn)入晚期內(nèi)吞體或MVBs降解。但CMA和eMI也存在明顯不同,例如eMI不需要底物蛋白質(zhì)的去折疊,而且eMI可以存在于多個(gè)物種中。另外,microproteophagy指的是通過(guò)內(nèi)吞溶酶體或液泡降解單個(gè)特定的蛋白質(zhì)的過(guò)程。與CMA或eMI不同,microproteophagy的底物沒(méi)有明確的特征 (比如KFERQ樣序列) ,但泛素化 (ubiquitination) 、ATG8ylation (一種新的蛋白翻譯后修飾) 或其他翻譯后修飾在介導(dǎo)microproteophagy發(fā)生過(guò)程中起到了重要作用。

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圖3. 哺乳動(dòng)物微線粒體自噬的分子機(jī)制

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圖 4 . CMA 和微自噬降解胞質(zhì)單個(gè)蛋白質(zhì) 

五、微自噬的分子調(diào)控機(jī)理 

在酵母中,微自噬的分子調(diào)控機(jī)制已經(jīng)得到廣泛研究。但在哺乳動(dòng)物細(xì)胞中,微自噬的確切調(diào)控機(jī)制在很大程度上仍不清楚。目前,對(duì)微自噬的分子調(diào)控機(jī)制的研究主要集中于底物識(shí)別 (cargo recognition) 以及底物吞噬和降解 (cargo engulfment and degradation) 兩個(gè)過(guò)程。其中泛素化和ATG8ylation在微自噬的底物識(shí)別過(guò)程中發(fā)揮了重要作用,而SNARE復(fù)合體、 ESCRTs復(fù)合體以及膜接觸位點(diǎn) (membrane contact sites) 和mTOR、TFEB參與了底物的吞噬和降解過(guò)程 (見(jiàn)表1) 。另外,MVBs也通過(guò)多種途徑參與微自噬的調(diào)控。 

六、微自噬在人類重大疾病中的功能意義 

微自噬具有多種生物學(xué)功能,其中包括蛋白質(zhì)質(zhì)量控制、細(xì)胞器重塑、神經(jīng)元突觸傳遞和胚胎發(fā)生等。不同類型的選擇性微自噬功能障礙與多種人類疾病的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān),其中以兩種衰老相關(guān)疾病,神經(jīng)退行性疾病和癌癥的最為典型。 

七、未來(lái)展望 

相對(duì)于巨自噬和CMA的研究,微自噬的研究還處于起步階段。在過(guò)去幾年,雖然我們對(duì)微自噬的研究積累了一定的認(rèn)識(shí),但是仍然有很多具有挑戰(zhàn)性的基本問(wèn)題沒(méi)有被探究和回答。 首先,在技術(shù)上,目前還沒(méi)有標(biāo)準(zhǔn)的方法,也沒(méi)有合適的體外細(xì)胞和體內(nèi)動(dòng)物模型來(lái)研究微自噬。其次,不同類型的選擇性微自噬的受體 (receptors) 尚未確定,也不清楚這些受體行使其功能時(shí)是否依賴泛素,是否會(huì)隨底物一起被降解,微自噬和巨自噬是否利用相同或不同的受體來(lái)實(shí)現(xiàn)特定細(xì)胞器的周轉(zhuǎn)。再次,微自噬的底物運(yùn)輸?shù)絻?nèi)吞溶酶體的分子機(jī)制還遠(yuǎn)未明確。ATG8ylation修飾在微自噬中的作用尚需要更加深入的研究。然后,巨自噬和微自噬這兩種進(jìn)化上密切聯(lián)系又明顯不同的自噬到底是什么關(guān)系,在同一個(gè)細(xì)胞中降解底物哪一種自噬更為高效。最后,我們?nèi)绾瓮ㄟ^(guò)精準(zhǔn)調(diào)控微自噬的水平來(lái)治療人類疾病,比如癌癥和神經(jīng)退行性疾病。因此,我們急需更加深入地研究微自噬的分子調(diào)控機(jī)制和生理病理功能。這些知識(shí)將會(huì)為自噬和溶酶體生物醫(yī)學(xué)的研究打開(kāi)一個(gè)新的窗口,更重要的是將為微自噬相關(guān)疾病的治療提供新的機(jī)遇。 

王立明:湖南大學(xué)生命醫(yī)學(xué)交叉研究院教授、博士生導(dǎo)師、岳麓學(xué)者。主要研究方向?yàn)椴捎皿w外細(xì)胞系、果蠅和小鼠等模式生物,研究自噬、線粒體自噬、線粒體穩(wěn)態(tài)、微線粒體自噬的分子機(jī)制和生理病理功能。為推動(dòng)團(tuán)隊(duì)發(fā)展,課題組誠(chéng)摯歡迎有生命科學(xué)、基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)以及相關(guān)交叉學(xué)科背景的博士后、助理教授等加盟合作。聯(lián)系郵箱:wangliming@hnu.edu.cn。

沈漢明 教授在澳門大學(xué)健康科學(xué)學(xué)院的實(shí)驗(yàn)室有充分的實(shí)驗(yàn)空間和完善的實(shí)驗(yàn)儀器設(shè)備,實(shí)驗(yàn)室有濃厚的學(xué)術(shù)氛圍,主要研究方向?yàn)榧?xì)胞自噬分子機(jī)制及調(diào)控、線粒體質(zhì)量控制機(jī)制和腫瘤代謝。

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