病理學(xué)家在過去100年都是以相同的方式來診斷疾病,一般都是在顯微鏡下手動地看所拍的片子。但是,新的研究表明,計算機(jī)可以幫助醫(yī)生提高看片的準(zhǔn)確性,以及有效改變癌癥和其他疾病的診斷方式。
貝斯以色列女執(zhí)事醫(yī)療中心(BIDMC)和哈佛醫(yī)學(xué)院(HMS)的一個研究小組最近開發(fā)研究出一種人工智能方法,旨在訓(xùn)練計算機(jī),讓它們可以解釋病理圖像,同時他們對此還有一個長期目標(biāo),就是建立一個人工智能系統(tǒng),從而能更準(zhǔn)確地進(jìn)行疾病診斷。
“我們的人工智能系統(tǒng),是基于“深度學(xué)習(xí)”技術(shù),其中所使用的機(jī)器學(xué)習(xí)算法可以用于一系列的應(yīng)用之中,包括語音識別和圖像識別,”貝斯以色列女執(zhí)事醫(yī)療中心癌癥研究所的生物信息學(xué)主安德魯?貝克博士這樣談道,同時貝克博士也是哈佛醫(yī)學(xué)院的一名副教授。“這種科技手段,主要是通過構(gòu)建多層人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),讓這些機(jī)器對現(xiàn)實(shí)生活中觀察到的復(fù)雜類型和結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,從頭到尾就類似于在人腦皮層的神經(jīng)元進(jìn)行學(xué)習(xí)的整個過程,而通常人的思維就是在這個領(lǐng)域產(chǎn)生的。
貝克博士實(shí)驗(yàn)室開發(fā)的這個理論,最近參加了一個研究比賽,這個比賽是由生物醫(yī)學(xué)成像國際研討(ISBI)年會一手操辦的,ISBI這個研討會主要是通過對淋巴結(jié)檢查圖像的研究來診斷是否患有乳腺癌。
由于不同于其他領(lǐng)域,醫(yī)學(xué)是一個生死攸關(guān)的領(lǐng)域,尤其是癌癥的診斷,這些專家們不敢有一點(diǎn)馬虎,特別是又加入了人工智能這個新型技術(shù),這就要求必須有一個強(qiáng)有力的研發(fā)團(tuán)隊。
整個技術(shù)支持包括貝克的整個研究團(tuán)隊,還有其實(shí)驗(yàn)室的博士后研究員王大勇、胡伊爾沙德博士,和Rishab Gargya博士,此外還包括麻省理工學(xué)院計算機(jī)科學(xué)和人工智能實(shí)驗(yàn)室的阿迪亞?科斯拉,以上這些研究人員被分為兩隊,與來自全球各地的私營公司和學(xué)術(shù)研究機(jī)構(gòu)同臺競技。
該研究小組今天發(fā)布了一篇技術(shù)報告,他們希望這一份報告可以被采納于arXiv.org資料預(yù)印庫中,arxiv.org是全球最大的預(yù)印本系統(tǒng),由美國國家科學(xué)基金會和美國能源部資助,在美國洛斯阿拉莫斯國家實(shí)驗(yàn)室建立的電子預(yù)印本文獻(xiàn)庫,其中的文獻(xiàn)包括物理,數(shù)學(xué),計算機(jī)科學(xué),生物學(xué)定量,定量金融和統(tǒng)計等領(lǐng)域。
“對病理學(xué)家們而言,通過檢查患者的淋巴結(jié)從而確定患者是否發(fā)生了癌癥轉(zhuǎn)移,這是一個必要的檢查過程,也是非常重要的一環(huán)?!必惪私忉尩??!笆聦?shí)證明,使用傳統(tǒng)的方式,利用顯微鏡在數(shù)以百萬的正常細(xì)胞中篩選出幾個惡性細(xì)胞,是十分費(fèi)力的。我們都覺得計算機(jī)在這一塊一定可以做的很好,的確,事實(shí)證明果然如此。”
在一次客觀評估中,給了研究人員們一些淋巴結(jié)細(xì)胞的幻燈片,并問他們這些淋巴結(jié)腫是否含有癌細(xì)胞,結(jié)果,該小組的自動診斷體系92%的診斷都是正確的??扑估忉尩溃骸斑@幾乎與病理學(xué)家們96%的準(zhǔn)確率差不多?!?/p>
“但是,真正令人興奮的事情是,當(dāng)我們把病理學(xué)家的分析與我們的自動計算診斷方法結(jié)合起來的時候,診斷的準(zhǔn)確率提高到99.5%,”貝克說道?!鞍堰@兩種方法相結(jié)合,所產(chǎn)生的誤差會大幅減少。”
該研究小組是根據(jù)深度多層次的卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),來訓(xùn)練計算機(jī)對癌性腫瘤區(qū)域和正常區(qū)域進(jìn)行區(qū)分的。
“在我們的方法中,我們一開始就利用上百張的幻燈片對其進(jìn)行訓(xùn)練,與此同時病理學(xué)家們對腫瘤區(qū)域和正常細(xì)胞區(qū)域也進(jìn)行了標(biāo)示,”王大勇說道?!叭缓螅覀儗@些訓(xùn)練樣本進(jìn)行提取,然后使用深度學(xué)習(xí)建立一個計算模型對它們進(jìn)行分類。”
研究小組隨后對計算機(jī)容易犯錯誤的樣本進(jìn)行標(biāo)記,再反復(fù)使用更難的案例去訓(xùn)練它。通過這種方式,計算機(jī)的性能得到不斷地改善。
“如今,無可厚非的一點(diǎn)是數(shù)字化圖像,和機(jī)器學(xué)習(xí)的使用可以幫助病理學(xué)家更快、更準(zhǔn)確地對患者做出診斷,”貝克補(bǔ)充道?!斑@是在病理領(lǐng)域30多年來的一個大使命。然而只有在不斷改進(jìn)的掃描、存儲、處理和算法的幫助下,才有可能行之有效地實(shí)現(xiàn)這個大使命。我們在ISBI競賽中取得的成績說明了,計算機(jī)現(xiàn)在已經(jīng)實(shí)現(xiàn)了真正的智能,另外,人機(jī)認(rèn)知的結(jié)合在治療診斷指導(dǎo)上將會更精確,也更具臨床價值?!?/p>
作為荷蘭內(nèi)梅亨大學(xué)數(shù)字病理學(xué)研究小組的負(fù)責(zé)人和此次比賽的組織者,吉榮?范?德?拉克博士這樣說,“當(dāng)我們開始這個比賽時,就期待出現(xiàn)一些有趣的結(jié)果。然而我們?nèi)f萬沒有想到的是,計算機(jī)在醫(yī)療診斷方面竟然可以與人類媲美。透過這一研究,我們可以清除地認(rèn)識到,人工智能在不遠(yuǎn)的將來,將會改變我們處理組織病理學(xué)圖像的方式。而人工智能的參與,將會幫助醫(yī)生們更好地篩選癌細(xì)胞,從而給人類的健康帶去更多的一份保障。”
貝克博士和科斯拉最近成立了一個初創(chuàng)公司(名為PathAI),他們旨在開發(fā)和應(yīng)用AI技術(shù),使其成為病理學(xué)領(lǐng)域的忠實(shí)助手。
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