哥倫比亞大學(xué)Harris H. Wang團隊?在《Nature Microbiology》期刊上(IF=28.3)發(fā)表了關(guān)于409種細菌-藥物對揭示腸道微生物群擾動的驅(qū)動因素的文章，該研究通過對轉(zhuǎn)錄組學(xué)測定結(jié)果進行生信分析，強調(diào)了大規(guī)模轉(zhuǎn)錄組學(xué)在腸道微生物-外源化學(xué)物相互作用的功能發(fā)現(xiàn)方面的實用性。

期刊：Nature Microbiology

影響因子：28.3

發(fā)表時間：2024.02

樣本類型：細菌、人糞便

一、研究背景

許多藥物可以擾亂腸道微生物群，有可能導(dǎo)致負(fù)面的健康后果。然而，大多數(shù)微生物-藥物反應(yīng)的機制尚未在遺傳水平上闡明。本研究利用高通量轉(zhuǎn)錄組學(xué)，系統(tǒng)地描述了暴露于最常用的口服藥物的流行的人類腸道細菌的基因表達譜，為了解藥物介導(dǎo)的微生物群轉(zhuǎn)移的驅(qū)動因素提供了一個資源，以便更好地了解臨床干預(yù)。

二、研究思路

圖 研究思路 注：BMIS：自身體質(zhì)量指數(shù)譜

三、研究結(jié)論

本研究通過高通量原核轉(zhuǎn)錄組學(xué)方法，系統(tǒng)分析了常用口服藥物對常見人類腸菌基因表達的影響，涉及409個藥物-腸菌配對，為理解藥物介導(dǎo)的菌群改變提供了機制性見解和研究資源；他汀類藥物能上調(diào)擬桿菌目細菌的AcrAB-TolC外排泵，使這些菌對膳食成分（如維生素A）和次級膽汁酸的抗菌/毒性作用更敏感，服用辛伐他汀的患者中攜帶acrAB-tolC基因的腸菌減少，側(cè)面印證他汀類藥物引起的腸菌acrAB-tolC表達上調(diào)會影響細菌活性。

參考文獻

Ricaurte D, et al. High-throughput transcriptomics of 409 bacteria-drug pairs reveals drivers of gut microbiota perturbation. Nat Microbiol. 2024.返回搜狐，查看更多

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